今天是第期日报。
Immunity：皮肤损伤可能引发食物过敏Immunity[IF:19.]
①用胶带粘连剥离小鼠皮肤可代替抓挠，处理后小鼠小肠中肥大细胞（MC）扩增并活化，肠道通透性增加，会促进敏感型个体发生食物过敏；②胶带剥离处理会导致全身角质细胞释放IL-33，IL-33与肠道簇细胞分泌的IL-25协同作用，共同促进肠道2型先天淋巴细胞（ILC2）扩增和活化；③ILC2产生的IL-4直接引发MC在肠道中扩增；④ILC2产生的IL-13促进肠道簇细胞扩增和IL-25的表达，进一步推动ILC2扩增；⑤特应性皮炎患者十二指肠中MC确实存在扩增现象；
MechanicalSkinInjuryPromotesFoodAnaphylaxisbyDrivingIntestinalMastCellExpansion04-23,doi:10./j.immuni..03.
特应性皮炎患者对包括食物或食物相关过敏原敏感。《Immunity》近期发表研究，发现皮肤划伤不仅会促进特应性皮炎患者的皮肤对食物抗原敏感，还通过引发肠道肥大细胞扩增的方式促进食物过敏。该研究有助于阐释特应性皮炎和食物过敏间的联系，促进对肠-皮肤轴的理解。（
小肠君）Cell子刊：抵御沙门氏菌感染的低丰度共生菌CellHostandMicrobe[IF:17.]
①黏蛋白敲除小鼠缺乏正常的肠道粘液层，但肠道细菌Mucispirillumschaedleri帮助宿主抵御鼠伤寒沙门氏菌（S.Tm）引发的肠道炎症；②M.schaedleri够抵御S.Tm引发的结肠炎，但不影响S.Tm的肠道定植；③M.schaedleri在肠道内与沙门氏菌竞争厌氧呼吸底物，抑制沙门氏菌毒力因子的表达，从而抵御结肠炎；④M.schaedleri广泛分布于啮齿类动物中，小鼠是否携带该菌会影响S.Tm感染实验结果；⑤M.schaedleri富集于人体肠黏膜中，粪便中较少。
MucispirillumschaedleriAntagonizesSalmonellaVirulencetoProtectMiceagainstColitis04-18,doi:10./j.chom..03.
《CellHostandMicrobe》近期发表一项研究，在一次结果异常的沙门氏菌感染实验中，发现小鼠携带的低丰度共生菌Mucispirillumschaedleri可以通过竞争营养物质，帮助宿主抵抗鼠伤寒沙门氏菌感染，从而干扰沙门氏菌感染模型的建立。该研究不仅发现共生菌协助抵御肠道感染的一种机制，还指出了共生菌群差异对动物实验结果的影响，值得参考。（
小肠君）MGS-Fast：快速注释菌群宏基因组测序数据的方法GigaScience[IF:7.]
①在得到宏基因组测序数据之后，直接使用Bowtie2短序列比对工具将Reads比对到注释好的综合参考基因数据库中；②这个参考基因数据库源于人体菌群测序已经取得的成果；③由于抛弃了组装等计算耗时的步骤，该方法在时间花费上大大改善，在测试中超过了Kraken等工具；④Bowtie2比对可以保证序列相似性在90%以上，因此注释结果的可靠性也比较高；⑤该方法已经被整合进Galaxy方法流，可通过Docker镜像获取。
MGS-Fast:Metagenomicshotgundatafastannotationusingmicrobialgenecatalogs04-03,doi:10./gigascience/giz
华大基因主办的期刊《GigaScience》近期发表文章，使用既有的微生物基因目录注释宏基因组测序数据，大大提高了工作效率。这种操作依赖于可靠的基因目录支持。考虑到包括华大基因在内的多个研究机构都曾致力于构建肠道菌群的基因目录（
